Jerome Karle, oprindeligt navn Jerome Karfunkle, (født 18. juni 1918, Brooklyn, New York, USA - døde 6. juni 2013, Annandale, Virginia), amerikansk krystallograf, der sammen med Herbert A. Hauptman blev tildelt Nobelprisen for Kemi i 1985 til deres udvikling af matematiske metoder til at trække molekylstrukturen af kemiske forbindelser fra mønstrene dannet, når røntgenstråler diffraheres af deres krystaller.
Karle var en klassekammerat af Hauptman's på City College i New York, hvorfra de begge dimitterede i 1937. Karle fortsatte med at få en ph.d. grad i fysisk kemi ved University of Michigan i 1943. Efter at have arbejdet på Manhattan-projektet i 1943–46, sluttede han sig til Naval Research Laboratory (NRL) i 1946, hvor han i 1967 blev den vigtigste videnskabsmand for forskning i materiens struktur; han trak sig i pension i 2009.
Efter 2. verdenskrig begyndte Karle og Hauptman at samarbejde på NRL om studiet af krystalstrukturer. De to mænd udtænkte matematiske ligninger for at beskrive arrangementerne af adskillige pletter, der vises på fotografisk film som et resultat af en krystals diffraktion af røntgenstråler. Deres ligninger muliggjorde lokalisering af atomer i krystalens molekyler på grundlag af en analyse af intensiteten af pletterne. Efter deres metode blev offentliggjort i 1949, led det forsømmelse i nogle år, indtil Karles kemikone, Isabella, påpegede dens potentielle anvendelser. Efterhånden begyndte krystallografer at anvende metoden til at bestemme den tredimensionelle struktur af tusinder af små biologiske molekyler, inklusive dem med mange hormoner, vitaminer og antibiotika. Før Karle og Hauptman udviklede deres metode, tog det to år at deducere strukturen af et simpelt biologisk molekyle; I 1980'erne tog det to dage at bruge kraftfulde computere til at udføre de komplekse beregninger, der kræves efter deres metode.
