Ørkenen områder
Den sydøstlige del af Indus-sletten, fra det østlige Bahawalpur til Thar Parkar-regionen i syd, er en typisk ørken, en forlængelse af Thar-ørkenen mellem Pakistan og Indien. Det er adskilt fra den centrale irrigerede zone af sletterne med den tørre seng af Ghaggar-floden i Bahawalpur og den østlige Nara-kanal i Sind. Ørkenen er forskellige kendt som Cholistan eller Rohi-ørkenen i Bahawalpur og Pat- eller Thar-ørkenen i Sind. Overfladen af ørkenen er en vild labyrint af klitter og sandryge. Det meste af Sind Sagar Doab, den mest vestlige af doaberne i Punjab, var en uproduktiv ødemark (kendt som Thal-ørkenen) før opførelsen af Jinnah Barrage på floden Indus nær Kalabagh i 1946. Thal-kanalsystemet, der trækker vand fra spærringen har forvandlet dele af ørkenen til frugtbart dyrket land.
Jord
Pakistans jord er klassificeret som pedokaler, der omfatter en tør jordgruppe med høje koncentrationer af calciumcarbonat og et lavt indhold af organisk stof; de er karakteristiske for et land med lav og uberegnelig nedbør. De største jordgrupperinger er indusbassinjord, bjergjord og sandørkenjord. Selve formen for jorddannelse giver imidlertid anledning til deres diversificering, selv inden for små områder. Disse jordarter varierer i struktur, kemisk sammensætning, farve og organisk indhold fra sted til sted.
Indus bassinjordene er for det meste tyk alluvium afsat af floder og er af nyere oprindelse. Jord i nærheden af flodbaner er den nyeste og varierer i tekstur fra sand til silt loam og silty ler. De har et lavt organisk indhold og er samlet kendt som khaddar-jorden. Væk fra floden, mod midten af doaberne, er ældre alluviale jordarter (kaldet bangar) vidt fordelt. Disse jordarter er mellemstore til fine i struktur, har lavt organisk indhold og er yderst produktive under kunstvanding og befrugtning. I nogle vandfyldte områder saltes disse jordarter imidlertid. Stærkt alkaliske jordarter er lokaliseret i nogle små pletter. I submontane områder under subhumide forhold er disse jordarter ikke kalkholdige og har lidt højere organisk indhold. I deltaet er estuarinjordene overdreven saltvand og golde.
Bjergjord er begge resterende (dvs. dannet i en stationær position) og transporteres. Lavt jordbund er udviklet langs skråningerne og i det ødelagte bjergland. Disse jordarter er generelt stærkt kalkholdige og har lavt organisk indhold, men under subhumide forhold øges deres organiske indhold.
Sand ørkenjord dækker Cholistan-delen af Sind Sagar Doab og det vestlige Balochistan. De inkluderer både skiftende sandjord og lerholdig oversvømmelsesjord. Disse inkluderer moderat kalkholdig og eolisk (vindbåret) jord.
