Seglet fra New Hampshire blev vedtaget i 1784 efter Revolutionen. Den 28. december 1792 blev en lovgivning vedtaget af lovgiveren, der krævede regimenter i statsmilitsen for at bære det nationale flag og de regimentære farver, der viser statens segl. Mere end et århundrede gik imidlertid før vedtagelsen af et statsflag til generelle formål. I loven fra 1909 blev der foreskrevet en blå baggrund, der bærer statsforseglingen i midten, indrammet af en laurbærkrans med ni stjerner ispedd, hvilket angiver rang af New Hampshire som den niende stat til at ratificere den amerikanske forfatning.
Seglet, der blev lidt ændret i 1931, indeholder fregatten Raleigh, der blev bygget i Portsmouth. Selvom skibet blev bygget i 1776, viser sælen det flagende flag, der ikke blev vedtaget før i 1777.