Afløb
På grund af dets klimatiske karakteristika og arrangement af landformer, har Mexico få store floder eller naturlige søer. De største findes i den centrale del af landet. Lerma-floden har sine overløb i Toluca-bassinet, vest for Mexico City, og flyder vestover for at danne Lake Chapala, landets største naturlige sø. Floden Santiago flyder derefter ud af søen mod nordvest og krydser Sierra Madre Occidental på vej til Stillehavet. Det øststrømmende farvand i floden Pánuco og dens sideelver, floderne Moctezuma og Santa María, har oprindelse i den østlige Mesa Central og tumler gennem kløfter i Sierra Madre Oriental på vej til Mexicogolfen. Søerne Pátzcuaro og Cuitzeo, vest for Mexico City, er rester af store søer og myrer, der dækkede meget af det sydlige Mesa Central inden europæisk bosættelse.
Der er få permanente vandløb i den tørre Mesa del Norte, og de fleste af disse drænes ind i det indre snarere end til havet. Den langt mest vigtige flod i denne del af landet er Río Bravo del Norte (kaldet Rio Grande i USA), som udgør en lang del af den internationale grænse. Conchos-floden, som er en sideelv fra Río Bravo, er vigtig for kunstvandingslandbrug og vandkraft.
Balsas-floden og dens sideelver dræner Balsas-depressionen såvel som meget af den sydlige del af Mesa Central. Nedstemt, hvor den krydser Sierra Madre del Sur, er Balsas en vigtig kilde til vandkraft. Længere sydøst på Guatemala-grænsen dræner Grijalva-Usumacinta-flodsystemet det meste af det fugtige Chiapas-højland. Sammen med Papaloapan-floden, der kommer ind i Mexicogolfen syd for Veracruz, tegner Grijalva og Usumacinta sig for cirka to femtedele af det samlede volumen af Mexicos floder.
Strømme ved vest- og østkystene er korte og stejle, fordi Sierra Madre Occidental og Sierra Madre Oriental stammer tæt på kystmargenerne. Langs Pacific Coastal Lowlands er floderne Yaqui, Fuerte og Culiacán blevet fordæmmet og understøtter store irrigationsfelter. Ariditet i Baja Californien og de porøse kalksten, der ligger til grund for Yucatán-halvøen, får disse regioner til at være næsten blottet for permanente overfladestrømme.
Jord
Gennem det tropiske sydøstlige Mexico producerer høje nedbørsmængder infertile rødlige eller gule lateritiske jordarter med høje jernoxider og aluminiumhydroxider. De rigeste jordarter i landet er den chernozem-lignende vulkanjord, der findes i Mesa Central. Nogle af disse mørke jordarter er dybt, let smuldrede og rige på basismineraler, der har været opdrættet kontinuerligt i mange århundreder. Overforbrug har imidlertid forårsaget alvorlig ark erosion og har udsat tepetat (en kalkhardpan) i mange områder. I det tørre nord indtager gråbrun ørkenjord den største vidder. Højt med kalk- og opløselige salte kan de være ekstremt produktive, når de overrisles, men i sådanne tilfælde kan saltopløsning (saltopbygning) være et alvorligt problem, hvilket resulterer i karrige marker.
