Nagasaki, ken (præfektur), nordvestlige Kyushu, Japan, mod østkinesiske hav. Det inkluderer øerne Tsushima, Iki og Hirado og Got of-øhavet. Byen Nagasaki er den præfekturelle hovedstad.
Præfekturet har en uregelmæssig form med den afrundede Shimabara-halvø og længere mod vest den smalle trekantede Nagasaki-halvø - de to, der afgrænser Tachibana-bugten - i sydøst. Shimabara-halvøen vaskes af Ariakehavet (nord og nordøst) og Shimabara-bugten (øst og sydøst). Halvøen Nishisonoki (Nishisonogi) omslutter den næsten jordbundne Ōmura-bugt langs præfekturets vestkyst nord for Nagasaki-byen. Prefekturets terræn er stort set bjergrigt, og det begrænsede landbrugsjord dyrkes intensivt med ris, søde kartofler og mandarin appelsiner. Fiskerisektoren giver flod og hellefisk.
Kulminedrift - hovedsagelig på Ha- og Taka-øerne ud for vestkysten af Nagasaki-halvøen - voksede i betydning fra slutningen af det 19. århundrede, men minedrift var ophørt i præfekturen i begyndelsen af det 21. århundrede. Der er lidt tung industri undtagen skibsbygning i Nagasaki by og ved flådebasen i Sasebo. En anden større by er Isahaya, der ligger mellem uramura Bay (vest) og Ariake Sea (øst). Nagasaki by har et universitet, der blev grundlagt i 1949. Areal 1.580 kvadrat miles (4.092 kvadratkilometer). Pop. (2010) 1.426.779.