Khalid Sheikh Mohammed, (født 1. marts 1964 eller 14. april 1965, Kuwait), islamistisk militant, der som operationel planlægger for al-Qaida masterminded nogle af organisationens højeste profilerede terroroperationer, især angrebene den 11. september på World Trade Center og Pentagon i 2001.
Før hans fødsel immigrerede Mohammeds forældre til Kuwait fra Pakistans Balochistan-provins. Mohammed blev opvokset i Kuwait, hvor han deltog i den offentlige gymnasium der, og han blev medlem af det muslimske broderskab som teenager. I 1983 flyttede han til USA for at gå på Chowan College (nu Chowan University) i Murfreesboro, North Carolina. Han flyttede til North Carolina Agricultural and Technical State University, og han tjente en grad i maskinteknik i 1986. Efter uddannelsen rejste Mohammed til Afghanistan, hvor han menes at have modtaget terroruddannelse under den sovjetiske besættelse af dette land.
Selvom han senere påtog sig ansvaret for bombningen af World Trade Center i 1993, kom Mohammed først til international opmærksomhed for hans deltagelse i den såkaldte Bojinka-plot, en dødbringende og vildt ambitiøs plan, der blev sammenarbejdet af Mohammeds nevø, Ramzi Yousef. Konspiratorerne, der har base i Manila, havde til formål at sprænge 11 amerikansk-bundne transpacific-luftfartøjer med praktisk talt uopdagelige bomber. Andre elementer af komplottet involverede angreb på pave John Paul II, US præsident. Bill Clinton og civile atomkraftværker. Filippinske embedsmænd opdagede grunden i januar 1995, da der opstod en brand i lejligheden i Manila, hvor Yousef og et konføderat, Abdul Hakim Murad, bygger bomber. Da Murad vendte tilbage til lejligheden, blev han arresteret. Yousef flygtede fra landet, men blev fanget i Pakistan i februar 1995 og udleveret til De Forenede Stater.
Et af de foreslåede aspekter af Bojinka-handlingen omfattede kapring af et fly og brug af det som et missil til at angribe hovedkvarteret for Central Intelligence Agency (CIA). Mohammed overtog denne plan til Osama bin Laden i 1996 med antagelsen af, at den blev brugt til at angribe symboliske mål i De Forenede Stater. Det menes, at bin Laden på et tidspunkt godkendte planen i slutningen af 1998 eller begyndelsen af 1999, og Mohammed begyndte sin formelle tilknytning til al-Qaida. Mohammed begyndte sammen med bin Laden og Muhammad Atef at samle kaprerholdene. I begyndelsen af december 1999 afholdt Mohammed et instruktionsmøde med tre al-Qaida-operativer, der ville gennemføre angrebene den 11. september.
Efter disse angreb skyder Mohammeds cachet inden i al-Qaida op. Han var involveret i andre planer mod De Forenede Stater, herunder forsøget på "sko-bombning" af en American Airlines-jet af Richard Reid, der blev folieret af passagerer den 22. december 2001. Mohammed hævdede også at have halshugget Wall Street Journal-reporter Daniel Pearl i 2002, et krav, der senere blev verificeret af uafhængige kilder. I begyndelsen af 2003 planlægger Mohammed et angreb på Londons Heathrow-lufthavn, men komplottet blev forstyrret af De Forenede Stater og dets allierede. Kort efter, den 1. marts 2003, blev han fanget af amerikanske og pakistanske officerer i Rawalpindi, Pakistan.
Under sit afhør af CIA blev Mohammed udsat for vandbræt mere end 180 gange. Efter at have tilbragt flere år i klassificerede CIA-sorte ”fængsler” i Centraleuropa blev han overført til Guantánamo-bugten i 2006. Den 11. februar 2008 blev Mohammed og fire andre tiltalt under det militære domstolssystem for forbrydelser relateret til september 11 angreb. Ved en forsøget høring indrømmede Mohammed sin rolle i snesevis af forskellige komplott mod USA, og under hans arrangering i juni 2008 erklærede han, at han ønskede at repræsentere sig selv og erklære sig skyldig. I november 2009 meddelte den amerikanske retsadvokat Eric Holder, at Mohammed og hans fire kokospiratorer ville blive overført til De Forenede Stater og retsforfulgt i en civil domstol i New York. I januar 2010 blev militære anklager mod Mohammed officielt henlagt af Pentagon, hvilket gjorde det muligt for civile retssager at fortsætte. I april 2011 meddelte Holder imidlertid, at på grund af begrænsninger, der blev indført af Kongressen, ville Mohammed blive retsforfulgt i en militær domstol snarere end i en civil ramme. Forsvarsministeriet genopfyldte anklager mod Mohammed, og han blev arrangeret for anden gang i maj 2012. Han forblev fanget i Guantánamo-bugten i afventning af retssag.